Top
IDMSB2-022C16
Information of forward sequence (DDBJ: AG625781)
Chromosome 7 position(base) 35638757 - 35639413 strand -
Alignment
seq1: chr7_35638757_35639413
seq2: MSB2-022C16_F_86_742 (reverse)

seq1  CATCACGTGCTCAGCCGACTCTGCTCTCATAATTTCCACCAAAGTAAACG  50
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACGTGCTCAGCCGACTCTGCACTCATAATTTCCACCAAAGTAAACG  50

seq1  TCAAGCCTGATTCTGCAAAATATCACACATTTCAATTTGCTGCATTTAAG  100
      |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGCATGATTATGCAAAATATCACACATTTCAATTTGCTGCATTTAAG  100

seq1  AACATTCTTGATATGTTATCCTTCTTTATCCCGGGCTCTTAAAATGCTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTCTTGATATGTTATCCTTCTTTATCCCGGGCTCTTAAAATGCTTT  150

seq1  TTCAAAACACTTGCTTGGACCTGTGGAAATAGGCGGTTCTGATGTTTGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAACACTTGCTTGGACCTGTGGAAATAGGCGGTTCTGATGTTTGCT  200

seq1  TTTTGAAGATAAGACGGCAGAAATGTTGAGGCCCTGATTGCATGGCTTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGAAGATAAGACGGCAGAAATGTTGAGGCCCTGATTGCATGGCTTGC  250

seq1  CTGGGCTCTGCCACTCCCATCTTTAGCCCAGTTCATTGCGCTCAAAGGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCTCTGCCACTCCCATCTTTAGCCCAGTTCATTGCGCTCAAAGGTG  300

seq1  GAAGGAGGCTGCTTCGGAAACCTGCGCCACCGGGTGTAATTACAGTACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAGGCTGCTTCGGAAACCTGCGCCACCGGGTGTAATTACAGTACCA  350

seq1  ACAGCCGACCTCTTTGCTACACCAATGGTCCAGTGACCGCTGCTCAGCAC  400
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCCGACCTCTTTGATACACCAATGGTCCAGTGACCGCTGCTCAGCAC  400

seq1  ATGACTCTTGGCCTGGGAACAAGATAATATTCACCGAGCGTGACTGCTGC  450
      |  |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAATGGCCTGGGAACAAGATAATATTCACCGAGCGTGACTGCTGC  450

seq1  ATCCAAGTCAGAGGCGAGGAGGAAAAACAAGCACTTGTTTTCCACATGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAAGTCAGAGGCGAGGAGGAAAAACAAGCACTTGTTTTCCACATGCA  500

seq1  TCTCCAAGGCTGCATTTCCAACTTGGCCATGGCCGTAGAAGCCAGAACCT  550
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TCTCCAAGGCTGCATTTCCAACTTGGCCATGGCCATAGAAGCCAGAACCT  550

seq1  TACAGCGTCTTGGCAATTAAATGATTTTCACGCTTCTATTTTTAAAAGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGCGTCTTGGCAATTAAATGATTTTCACGCTTCTATTTTTAAAAGCC  600

seq1  TTGGAACGAGTAACCTGGGGGATCAGAGTGGTTTGGTGAATGTCTTTGCA  650
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TTGGAGCGAGTAACCTGGGGGATCAGAGTGGTTGGGTGAATGTCTTTGCA  650

seq1  GAGCTCC  657
      |||||||
seq2  GAGCTCC  657

Information of reverse sequence (DDBJ: AG626117)
Chromosome 7 position(base) 35492415 - 35493087 strand +
Alignment
seq1: chr7_35492415_35493087
seq2: MSB2-022C16_R_67_744

seq1  TTTT-TTAAGAAGTTACTGTTTGAATTTCATAGTCTGAATTTTAGTTCAT  49
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTAAGAAGTTACTGTTTGAATTTCATAGTCTGAATTTTAGTTCAT  50

seq1  AAATGACCTAAACTGGAGGCTGTGGATCTAATTTCTGATCTTGGCTATAG  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGACCTAAACTGGAGGCTGTGGATCTAATTTCTGATCTTGGCTATAG  100

seq1  TACTCATTGTGCGAGTTTTGTAGGCCACCTAACGATCACTCTTCTGAATC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCATTGTGCGAGTTTTGTAGGCCACCTAACGATCACTCTTCTGAATC  150

seq1  TCTTCAGAGTACACCAAATTTTAAAAATTAAGTTGCGGCCGGGCGCAGTG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCAGAGTACACCAAATTTTAAAAATTAAGTTGCGGCCGGGCGCAGTG  200

seq1  GCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGCGAGGCCAAGGCGGGCGGATCAC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGCGAGGCCAAGGCGGGCGGATCAC  250

seq1  CTAAGGTTGGGAGTTGGAGACCAGCTTGGCCAGCATGGCGAAACCCCGTC  299
      |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGTTGGGATTTTGAGACCAGCTTGGCCAGCATGGCGAAACCCCGTC  300

seq1  TCTACTAAGCATACAAAAATTAGCGGGGCATGGTGGCAGGCTCCTGTAAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTAAGCATACAAAAATTAGCGGGGCATGGTGGCAGGCTCCTGTAAT  350

seq1  CCCAGCTACTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATTGCTGGAACCCAGGAGGC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCTACTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATTGCTGGAACCCAGGAGGC  400

seq1  GGAGGTTGCAGTGAGCTGTGATTGCACCATTACACTCCAGCATGGGCAAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGTTGCAGTGAGCTGTGATTGCACCATTACACTCCAGCATGGGCAAC  450

seq1  AGAGGAAGATTCCGTCTCAA----AAATAAATAAATAAATAACCAAACTA  495
      ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAAGATTCCGTCTCAAAAATAAATAAATAAATAAATAACCAAACTA  500

seq1  AGTTATATCATTTGGACAATGAATGATTGATAAAAGTAACTACAAAGAAT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATATCATTTGGACAATGAATGATTGATAAAAGTAACTACAAAGAAT  550

seq1  CATGTAGGTTTAAGCTTGTAAGCTCTGCAGACTGCGTCTGTGACATATCA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTAGGTTTAAGCTTGTAAGCTCTGCAGACTGCGTCTGTGACATATCA  600

seq1  TTAAGTTAACTTGTCTGCCACCCTGCTTCAGGGCCTTAAAAGTCTTTTCA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTTAACTTGTCTGCCACCCTGCTTCAGGGCCTTAAAAGTCTTTTCA  650

seq1  TCTTCATCTTAAATATAAGACAGCAGCT  673
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCATCTTAAATATAAGACAGCAGCT  678