Top
IDMSB2-060P20
Information of forward sequence (DDBJ: AG647939)
Chromosome 7 position(base) 36033886 - 36034569 strand +
Alignment
seq1: chr7_36033886_36034569
seq2: MSB2-060P20_F_83_765

seq1  CTTCTCCTTTTACAGTCTTAGTATTTTCTCTTCCTTCTCTACTTGGGATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCCTTTTACAGTCTTAGTATTTTCTCTTCCTTCTCTACTTGGGATG  50

seq1  TTTTTCCATCAGATTTTCCCACAGTTGATCATCTGTCATTCAAGTCCCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCCATCAGATTTTCCCACAGTTGATTATCTGTCATTCAAGTCCCAG  100

seq1  CTTAAAAGTGACCTCCTCAGAAAATCCAACCTCAGTCACCCAGTCAGAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CTTAAAAGTGACCTCCTCAGAAAATCCAACCTCAGTCTCCCAGTCAGAGT  150

seq1  AGTCTACCAGTCACTCCTTATCACATCACTCTGTACTAGTTCTCTTTGTG  200
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTACCAGTCACTCCCTATCACATCACTCTGTACTAGTTCTCTTTGTG  200

seq1  GCTCGTAGTGCTGATAGAATAAAAGTTTCAATGTAACAGGAAATTTCTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCGTAGTGCTGATAGAATAAAAGTTTCAATGTAACAGGAAATTTCTTT  250

seq1  GCCTTATTCATCGTTATAGCACCAAATCCTAGAATAGTATTTCGCTTATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTATTCATCGTTATAGCACCAAATCCTAGAATAGTATTTCGCTTATG  300

seq1  ATAGATGCTTAATAAATATTTACTTACTGAACAAATGAATGAGATCTCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATGCTTAATAAATATTTACTTACTGAACAAATGAATGAGATCTCCA  350

seq1  AGGAAGCAAGAACAGATGGGATCCATAGTATAGCTGAAGGGATTAACCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGCAAGAACAGATGGGATCCATAGTATAGCTGAAGGGATTAACCTT  400

seq1  GGATAAAATTCCTGTTGTTACTGCTGTTTAATAAACCACCCCAAATTTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAAAATTCCTGTTGTTACTGCTGTTTAATAAACCACCCCAAATTTGG  450

seq1  AAAAGGCATAGTGAAGATGTCTGTGCTCCAGTGTCTAAGGCTTCAATTCG  500
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGCATAGTGAAGATGTCTCTGCTCCAGTGTCTAAGGCTTCAATTCG  500

seq1  GAAGTCTTGAAGGCTGGAAGTGACTGGACAGATGGGGCTGAAATTATCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTCTTGAAGGCTGGAAGTGACTGGACAGATGGGGCTGAAATTATCCA  550

seq1  AAGTTTTGCTCACTTACATGTCTGGTGGTTGATGCTACCTGTTGGCCGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTTGCTCACTTACATGTCTGGTGGTTGATGCTACCTGTTGGCCGAA  600

seq1  CCTTCAGCTTAGGATGACGGCCAAAATATCTACACAAATGCAGGCTTCTT  650
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCAGCTTAGGATGACGGCCAANATATCTACACAAATGCAGGCTTCTT  650

seq1  CATGGCTTGCTTACTGAGTTCCAAGAGTAAGCAC  684
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CATGGCTTGCTTACTGAGTTCCAAGAGT-AGCAC  683

Information of reverse sequence (DDBJ: AG648263)
Chromosome 7 position(base) 36102908 - 36103589 strand -
Alignment
seq1: chr7_36102908_36103589
seq2: MSB2-060P20_R_88_765 (reverse)

seq1  TCTCAATCATCTGCTCCCAATCTACCTTCTCTTGTTCATCTCTTATCACC  50
      |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||
seq2  TCTCAATCATCTGCTCCCAATCTACC-TCTCTGTTTCATCTCTTATCACC  49

seq1  TTTCTTCTCTC-CTCCAGGTACCAGAGCTATATCCACATTGAAATATTGG  99
      |||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTC-TCTCTCTCNNCAGGTACCAGAGCTATATCCACATTGAAATATTGG  98

seq1  ATGCTCCGAAGAAATGCCACGTGTGTCTGGGCCTCTGATACTTAGCACAT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  ATGCTCCGAAGAAATGCCACGTGTGTCTGGGCCTCTGATACTTTGCACAT  148

seq1  GCTCTGTACACCTGAAACATCTTACACCATTTTGTACCTATTGCGATTGT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGTACACCTGAAACATCTTACACCATTTTGTACCTATTGCGATTGT  198

seq1  ATTTACCCTAAGACTTAGCAAATTCTGTCTTACATGAAGCCCTCCAGAAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTACCCTAAGACTTAGCAAATTCTGTCTTACATGAAGCCCTCCAGAAT  248

seq1  GCCCTAGGTGCAGCTAATCACTCACTGCATTTTATATGATCCTATGAACT  299
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTAGGTGCAGCTAATCACTCATTGCATTTTATATGATCCTATGAACT  298

seq1  TATGCTATAACAATGGGACTAATGTTTCTGTATTTCTTACCAATCTGTGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTATAACAATGGGACTAATGTTTCTGTATTTCTTACCAATCTGTGA  348

seq1  GCCCCTTGAGTCTATAACCATATTATCTTTGTACCTCAATTGTTTGGCCC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTTGAGTCTATAACCATATTATCTTTGTACCTCAATTGTTTGGCCC  398

seq1  CCAGAAGACATATTGTTGTTGATTGAATAAGTAAAACAAAATACCTAGAA  449
      ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAGACATA---TTGTTGATTGAATCAGTAAAACAAAATACCTAGAA  445

seq1  TATCTTTTTAAATATTTACAATGTTTTACTCTGACACATCCTTATTTTGG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTTTTAAATATTTACAATGTTTTACTCTGACACATCCTTATTTTGG  495

seq1  CATTGCTTATATATTAGGATACTTGTAGCAATTACAGAAAATCTATCTGC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCTTATATATTAGGATACTTGTAGCAATTACAGAAAATCTATCTGC  545

seq1  ATAAACTTAAATAAGAGACAAGTATTGGTTCACATAACTTGCTGTGAAAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACTTAAATAAGAGACAAGTATTGGTTCACATAACTTGCTGTGAAAA  595

seq1  GGGCAGTGTAAAGCTGACTTTCTGATTTTCTAAAGCTGATTTTTGGATCC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAGTGTAAAGCTGACTTTCTGATTTTCTAAAGCTGATTTTTGGATCC  645

seq1  TTGTTTCTGAAAACAAGGATTCAAATGTGCTCA  682
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTCTGAAAACAAGGATTCAAATGTGCTCA  678