Top
IDMSB2-068A07
Information of forward sequence (DDBJ: AG652402)
Chromosome 7 position(base) 36456849 - 36457287 strand -
Alignment
seq1: chr7_36456849_36457287
seq2: MSB2-068A07_F_248_701 (reverse)

seq1  GAAATA-TCAATC-CCAAAGC-AGATGGACTG-AAAGGTGAAAACCTGGC  46
      |||||| ||  || ||||||| ||||||| || |||||||||||||  ||
seq2  GAAATATTCTTTCTCCAAAGCAAGATGGATTGAAAAGGTGAAAACCCTGC  50

seq1  --TGAGGAAAAGGG--AGTATGAAA-TAGAGCCACCAAA-CGGAATCATC  90
        ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||
seq2  CATGAGGAAAAGGGGAAGTATGAAATTAGAGCCCCCAAACCGGAATCCTC  100

seq1  -AAGTT-CAGGAGGATCTGGAACCTGG-AGAGAGAATCCCTGAGAGTGGA  137
       ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||
seq2  AAAGTTCCAGGAGGATCTGGAACCCGGAAGAGAGATTCCCTGAGAGTGGA  150

seq1  ATGGG-AAGCAAGTTCTTTCTTG-AAGGGAACCTGTCTGTGGGTAGAAGG  185
      ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGAAAGCAAGTTCTTTCTTGAAAGGGAACCTGTCTGTGGGTAGAAGG  200

seq1  AGCAGTTCAGTAATAACAGTGAGTTGTTAAGGCAGCCATTCCCTCCATTC  235
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTTCAGTAATAACAGTGAGTTGTTAAGGCAGCCATTCCCTCCATTC  250

seq1  TAATCCATGTTTTCCAAGATTCCAAGAGTAATTTGGCTCCTCCGATAGAC  285
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCCATGTTTTCCAAGATTCCAAGAGTAATTTGGCTCCTCCGATAGAC  300

seq1  TTTACTACTAAGGAAGCATGTGCTGATCAGCCAACAGGGTAATCATGGTT  335
      |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||
seq2  TTTACTACTAAGGAAGCATGTGGTGATAAGACAACAGGGTAATCATGGTT  350

seq1  GTTCTGCACAATGTGAGTTAATAAATGGTCATCTTGTTTGTTAGTCAGTA  385
      |||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTGCACANTGTGAAAAAAAAAATGGTCATCTTGTTTGTTAGTCAGTA  400

seq1  TCTGGTGAATATTGTATCATGACTCAGTTCTCCAGGGCTCAGTCACATTT  435
      ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||
seq2  TCTGGTGAATATTGTATCGCGACTCAGTTCTCCAGGGATCAGTCCCGTTT  450

seq1  GGGC  439
      ||||
seq2  GGGC  454

Information of reverse sequence (DDBJ: AG652742)
Chromosome 7 position(base) 36329861 - 36330523 strand +
Alignment
seq1: chr7_36329861_36330523
seq2: MSB2-068A07_R_86_749

seq1  AGAGCTCTATGGATATTAAGGAAATCAGGCCTCTGTCATAATATTGTGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTCTATGGATATTAAGGAAATCAGGCCTCTGTCATAATATTGTGAA  50

seq1  GATTTTTCCCCAATCTACTACTTATCTCTTGACTTTGTTTTATGTATATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTTCCCCAATCTACTACTTATCTCTTGACTTTGTTTTATGTATATT  100

seq1  ATTTTAAATGGAAGAAATTCAGAAGTAGGCTGGATTCTGCAACTGTATGA  150
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ATTTTAAATGGAAGAAATTCATAAGTAGGCTGGATTCTGCATCTGTATGA  150

seq1  AATTATTTTAAAATATCTATTACAACAAAAAATAGCGAAGATGTTGCAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATTTTAAAATATCTATTACAACAAAAAATAGCGAAGATGTTGCAAC  200

seq1  TGTCCATAGGATGACAATATGAAGTCTGAGTAATACTTTAAACATC-AAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |
seq2  TGTCCATAGGATGACAATATGAAGTCTGAGTAATACTTTAAACATCTTTA  250

seq1  TTAACTATTTACCTTTGTATGTAGACAATTGAAGAATCTTCTGGATATCA  299
      || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTATTTACCTTTGTATGTAGACAACTGAAGAATCTTCTGGATATCA  300

seq1  TTCTTTACAAGAGTACAAGTTTCCATGCTTTTTCAATTTGTAAAGTCTCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTACAAGAGTACAAGTTTCCATGCTTTTTCAATTTGTAAAGTCTCT  350

seq1  GAAAAGGTTTTTCATGAGGAGCCACACCACTGATCAATAAGCTAGAGTTT  399
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GAAAAGGTTTTTCATGAGGAGCCACACCACTGATCAATAAGCTAGAATTT  400

seq1  CATTTGCAAGAAAATCTTCTGCAACTGAACTTTCTAAGTTGGTTAAGGTG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGCAAGAAAATCTTCTGCAACTGAACTTTCTAAGTTGGTTAAGGTG  450

seq1  ATGGGTTCTAGTGGATAGTCACAAACCACAGAATCAGAGTAATGTCAAGG  499
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGTTCTAGTGGATAGTCACTAACCACAGAATCAGAGTAATGTCAAGG  500

seq1  TAGAGTGCAAATGGGACTGAGGAAAAAAATGGGAACATGAACAGAAGAGC  549
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTGCAAATGTGACTGAGGAAAAAAATGGGAACATGAACAGAAGAGC  550

seq1  ACAGGTGTTTACTTTAGCAGCACGTGTAGGAACCTGGAATAGTTCAGAAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ACAGGTGTTTACTTTAGCAGCACGTGTAGGAACCTGGAATAGTTCAGAAC  600

seq1  AAAACTCACAAGGCAACTACACAAGCACGGCATGGCAATTCATAAACCAT  649
      ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||
seq2  AAAACTCACAAGGCAACTACAGAAGCACGGTATGGCAATTCATTAAACAT  650

seq1  TTCCCCCTACACAT  663
      ||||||||||||||
seq2  TTCCCCCTACACAT  664