Top
IDMSB2-072P20
Information of forward sequence (DDBJ: AG655423)
Chromosome 7 position(base) 35637032 - 35637732 strand -
Alignment
seq1: chr7_35637032_35637732
seq2: MSB2-072P20_F_88_777 (reverse)

seq1  TGAACCACAAACTCTTCTCTTGCCCGGCCCTCTTCCCGGAAAGTTCCTGG  50
      |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACCACAAACTC-TCTC-TGCCCGGCCCTCTTCCCGGAAAGTTCCTGG  48

seq1  AACAAGCAGGAAGTCTTTCTGGGGATTTTAGTGATAGAATCTCAAGCCTG  100
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGCAGGAAGTATTTCTGGGGATTTTAGTGATAGAATCTCAAGCCTG  98

seq1  CTTTTCGGAATTCGCATCCGCGTTGTTTTTCCCAGTCTCACTCTCCCACC  150
      |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCAGAATTCGCATCCGCGTTG-TTTTCCCAGTCTCACTCTCCCACC  147

seq1  AAAGCCAGGACAGTGCTAGTCAAGTTCATAGCCAGAGTTCCGTGGGCATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AAAGCCAGGACAGTGCTAGTCAAGTTCATAGTCAGAGTTCCGTGGGCATT  197

seq1  CATTCCCTCATCCACCTCCTTTACTCGCATAACCCAGAACCACGGAGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CATTCCCTCATCCACCTCCTTTACTCGCATAACCCAGAACCACAGAGGCT  247

seq1  CCCCATAAACTCATCCAGGCCCTTCTGGGAACCTCCAGATGCAGTCTCGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATAAACTCATCCAGGCCCTTCTGGGAACCTCCAGATGCAGTCTCGC  297

seq1  GGGGCCCGCTCCCGGTCCTTTCATCGTCTCCCACTGGAGCCTCAGGGTGA  350
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GGGGCCCGCTCCCAGTCCTTTCATCGTCTCCCACTGGAGCCTCGGGGTGA  347

seq1  CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTCCG  400
      |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  C--------GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTCCG  389

seq1  CGCGCGCACGTGTGTGTGTTGATGGTGAAGCACACACGAGTGCTGTCCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCGCGCACGTGTGTGTGTTGATGGTGAAGCACACACGAGTGCTGTCCCC  439

seq1  TCACTGCCATGGCATCTTTGAGGCGCTGCGTCCAGGTCTGTGTCCCTTCA  500
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGCCATGGCATCTTTGAGGCACTGCGTCCAGGTCTGTGTCCCTTCA  489

seq1  GAGCAAACCTCCCAAGTAGCTAAACGGTGCCGTAACTGCTTCAGCGCTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAACCTCCCAAGTAGCTAAACGGTGCCGTAACTGCTTCAGCGCTCC  539

seq1  TGTGACCACATTGTGCTTTGCGTGCGTCTATGAGAGCCACTCTCCAGTCT  600
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCCACATTGTGCTTTGCGTGCGTCTATGAGAGCCACTCTCCAGTCT  589

seq1  GTGTCCCGCCCTCTCACTGAGGCCTGGAACCTCAGCTTGTGCTGTGTGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCCGCCCTCTCACTGAGGCCTGGAACCTCAGCTTGTGCTGTGTGCT  639

seq1  CCACCAAGACCCTTGTGAAAATGGCCACCAGGCTGTTCTCTACTGGGGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCAAGACCCTTGTGAAAATGGCCACCAGGCTGTTCTCTACTGGGGAC  689

seq1  A  701
      |
seq2  A  690

Information of reverse sequence (DDBJ: AG655779)
Chromosome 7 position(base) 35632042 - 35632721 strand +
Alignment
seq1: chr7_35632042_35632721
seq2: MSB2-072P20_R_88_766

seq1  AGCCAAGGTACGGTGTATGGATTGGACTTTGGTAGAAGATGGTAAGAACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAAGGTACGGTGTATGGATTGGACTTTGGTAGAAGATGGTAAGAACC  50

seq1  AAACACCTGAGAAACCACTTTGAAGATCAGGGTCAGAGTAAGGCCTAACA  100
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACCTGATAAACCACTTTGAAGATCAGGGTCAGAGTAAGGCCTAACA  100

seq1  CATAGTTGGCTCTCAGTAATTATTGGTTGATTGAATGGCTCAAAGAGCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTTGGCTCTCAGTAATTATTGGTTGATTGAATGGCTCAAAGAGCAA  150

seq1  CTCGACCAAGAACGCTGGACTGGGAGTCCAGTTACTTGGGGCTTGCATCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGACCAAGAACGCTGGACTGGGAGTCCAGTTACTTGGGGCTTGCATCC  200

seq1  CTGATTTATTTTTATTTTATATTTATATGTGTTTTATTTTTTGAGACGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATTTATTTTTATTTTATATTTATATGTGTTTTATTTTTTGAGACGGA  250

seq1  ATCTCACTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCATGATCTTAGC  300
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCACTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCATGATCTTAGC  300

seq1  TCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCT  350

seq1  CTCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCAGCTAATTTTTG  400
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCAGCTAATTTTTG  400

seq1  TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCATGCTGGTCTCGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCATGCTGGTCTCGAC  450

seq1  CTCCTGACCTCAGGTGATCTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGACCTCAGGTGATCTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGAT  500

seq1  TACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCGTGATTTATTTTTTCGTGTATGT  550
      |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGGCGTGAGCCACCGTGCCTTGCCGTGATTTATTTTTTCGTGTATGT  550

seq1  TTGTTTTTGTCAACTTGCTGTGTGACCCTAAGCAAGTTACTTAACTTCTC  600
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TTGTTTTTGTCAACTTGCTGTGTGACCCTAAGCAAGTTACTTTACTTCTC  600

seq1  TGGGCTTCACTTTCCATGGATG-AAAATTGTAAAGAGGTTGGAGAGAGAA  649
      |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
seq2  TGGGCTTCACTTTCCATGGATGAAAAATTGT-AAGAGGTTGGAGAGAG-A  648

seq1  GAGGACTA-GGTCCAGGCCTTAGAGGAGAGCC  680
      |||||||| | |||||| ||||||||||||||
seq2  GAGGACTATGTTCCAGG-CTTAGAGGAGAGCC  679