Top
IDMSB2-145N02
Information of forward sequence (DDBJ: AG704172)
Chromosome 7 position(base) 36812788 - 36813490 strand -
Alignment
seq1: chr7_36812788_36813490
seq2: MSB2-145N02_F_80_781 (reverse)

seq1  TAGCAAGTGCGTGCATTATCTTTCTTTTAAATTTTAACTTTATTTTTAAT  50
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAAGTGCGTGCATT-TCTTTCTTTTAAATTTTAACTTTATTTTTAAT  49

seq1  CAGCTGATGAAGTCACATGTACAAAATCATGAAAGTTACACAATGGTACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGATGAAGTCACATGTACAAAATCATGAAAGTTACACAATGGTACA  99

seq1  TGGTAAAAAGTCTTCCTCCCAGCCCTGTCCCCAGTCACCCAGTTTCCAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAAAAAGTCTTCCTCCCAGCCCTGTCCCCAGTCACCCAGTTTCCAGC  149

seq1  CTAGAGACACCTAATGGGAGCCCTTTCTTCTGCCGTTTTTAGAGACAGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAGACACCTAATGGGAGCCCTTTCTTCTGCCGTTTTTAGAGACAGTC  199

seq1  CATGCATTGCAGGTATTTTCTTTTAAAATAATCACAATAAAGTGAACTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCATTGCAGGTATTTTCTTTTAAAATAATCACAATAAAGTGAACTGG  249

seq1  AAGAAACGTTCCACTGACCTCGCCACCCTCTCCAGCTCATGCTGTGTTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAACGTTCCACTGACCTCGCCACCCTCTCCAGCTCATGCTGTGTTCT  299

seq1  CCAGAGCCAAGCTTTCAGACAGGGTTGTCTACGTGTATGGAGGAGTAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGCCAAGCTTTCAGACAGGGTTGTCTACGTGTATGGAGGAGTAAAA  349

seq1  ACAGTTCCTCGGGCTTTGGGGTCAGACAAACCTGAGTCTTCAATAATTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTCCTCGGGCTTTGGGGTCAGACAAACCTGAGTCTTCAATAATTGA  399

seq1  CCCAACCTCTCTAGGTCTTATGGCGTCACCTATAAAATGGACAATTCATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAACCTCTCTAGGTCTTATGGCGTCACCTATAAAATGGACAATTCATA  449

seq1  CCTGGCTCTTAGGTTGTTATAAGGGTAAGAAACAGTCCATGAAAAGCACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCTCTTAGGTTGTTATAAGGGTAAGAAACAGTCCATGAAAAGCACA  499

seq1  TGGGTCACTTAGCCACAGCCACTCTAACACTCTGGGCACCAGCGCCCTCC  550
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTCACTTAGCCACAGCCACTCTAACGCTCTGGGCACCAGCGCCCTCC  549

seq1  ATGGCTGGGACCCCTCCTCACTGAGCAGTGCTCCTGGAGGCAGCCAGAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTGGGACCCCTCCTCACTGAGCAGTGCTCCTGGAGGCAGCCAGAGA  599

seq1  CCACAAGACCCCTGGATGTCCCCCTAATCCCCTGAGAAGTACGTCCTGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAAGACCCCTGGATGTCCCCCTAATCCCCTGAGAAGTACGTCCTGTA  649

seq1  TTTCTGAGGTAACATTTTACAGTAAACATCTACAGCAAGCAAAAAACCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGAGGTAACATTTTACAGTAAACATCTACAGCAAGCAAAAAACCTT  699

seq1  GAG  703
      |||
seq2  GAG  702

Information of reverse sequence (DDBJ: AG704505)
Chromosome 7 position(base) 36688970 - 36689800 strand +
Alignment
seq1: chr7_36688970_36689800
seq2: MSB2-145N02_R_65_771

seq1  AAAACTGTGTCTCATGACCCTCTGTGTGGCCTCAGTCTCAGGAAATTGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTGTGTCTCATGACCCTCTGTGTGGCCTCAGTCTCAGGAAATTGCA  50

seq1  TGGGGGAATGGTGGCCAATTTGGAAGTGCAATCATGTTCACTTTCCTGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGAATGGTGGCCAATTTGGAACTGCAATCATGTTCACTTTCCTGCT  100

seq1  ATCTTGCCAGTCACACAGAAGCCATTTAAGACACAGAATTTCTTCTTGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTGCCAGTCACACAGAAGCCATTTAAGACACAGAATTTCTTCTTGCA  150

seq1  GCACATCTTCCCTAAAGTGTGAGTCAGCCTCACCCACATCTATACAGCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATCTTCCCTAAAGTGTGAGTCAGCCTCACCCACATCTATACAGCTG  200

seq1  CATCAAGCCTCCTGGTAACACACGCACACACGCATGCACACACGCACGCA  250
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CATCAAGCCTCCTGGTAACACACGCACACACGCACGCACACACGCACGCA  250

seq1  CACACGCACGCACACACGCACGCACACACGCACGCACACACGCACGCGCG  300
      ||||||||||||||||||                                
seq2  CACACGCACGCACACACG--------------------------------  268

seq1  CACACACACACACACACGCACACACACACGCACACACACGCACACACACG  350
                                      ||||||||||||      
seq2  --------------------------------CACACACGCACA------  280

seq1  CACGCACACACACGCACGCACACACACGCGCGCACACACACACACACACG  400
                                    ||||||||||||| ||||||
seq2  ------------------------------CGCACACACACACGCACACG  300

seq1  CACACACACGCGCACACACGCACACACACGCGCACACACGCACGCGCACA  450
      ||||||||||||||| ||||| | ||||||    ||||||||||||| ||
seq2  CACACACACGCGCACGCACGCGCGCACACG----CACACGCACGCGCGCA  346

seq1  CACACGCGCGCACACGCACGCACACACACACACGCGCGCACACACACGCA  500
      ||        ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||
seq2  CA--------CACACGCACG--CACACACACACGCACGCACACACA--CA  384

seq1  CACGCACACACACACGCGCACACACACGCACACACATACACACATCCAAG  550
      ||||||||||         ||||||||||||| || ||||||||||| ||
seq2  CACGCACACA--------GACACACACGCACAGACGTACACACATCCTAG  426

seq1  TAATCTGGAGCCCGCTGCTGCTGCTGTGACCAGGGGCTTCTGCACAGACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TAATCTGGAGCCCGCTGCTGCTGCTGTGACCAGAGGCTTCTGCACAGACC  476

seq1  TCCATTCCTCCTCCTCCCCAAGTCTCATGCCCATCCTCATGCTCCCATTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTCCTCCTCCTCCCCAAGTCTCATGCCCATCCTCATGCTCCCATTC  526

seq1  GGGGAGTTAGATTTCTGCCTAACATGACTCCTCGGGCCCTGTACCTCTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
seq2  GGGGAGTTAGATTTCTGCCTAACATGAATCCTCGGGTCCTGTACCTCTCT  576

seq1  CGGGGCTAGAGATCTATCCCCAAGCTACTAGTTGAGGTCTGCTCCAAGGG  750
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGGCTAGAGATCTATCCTCAAGCTACTAGTTGAGGTCTGCTCCAAGGG  626

seq1  GACTCTGGCACCAGCTGCGTGCCTGGTTCCTTTTGCTGTCCTGGCTAACG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCTGGCACCAGCTGCGTGCCTGGTTCCTTTTGCTGTCCTGGCTAACG  676

seq1  ATGAGAGCAAGGGCTTAAGACTCAGGCAGGC  831
      |||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  ATGAGAGCAAGGGCTTAAGACTCATGCAGGC  707