Top
IDMSB2-256M12
Information of forward sequence (DDBJ: AG777533)
Mapping result un_mapped (repeat)
BAC sequence 

    

   


  		
  
      

    

     Information of reverse sequence (DDBJ: AG777880)
    

    

     Chromosome
     7
     position(base)
     35424463 - 35425186
     strand
     +
    

    

    
    

    
Alignment

    
seq1: chr7_35424463_35425186
seq2: MSB2-256M12_R_65_784

seq1  GGACCACCTTTACTGTTATTTGTTTATCCAGTGCATTTCCTCATTGTCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCACCTTTACTGTTATTTGTTTATCCAGTGCATTTCCTCATTGTCAC  50

seq1  TTGGGTGTGCATTGTCTATGATCAGTAGTCATCTTTATGGATCCTTATTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTGTGCATTGTCTATGATCAGTAGTCATCTTTATGGATCCTTATTG  100

seq1  TTTTATAGTGGGCCAGTTGCATAGATCTGATAAATGATTCTTCTTTGAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATAGTGGGCCAGTTGCATAGATCTGATAAATGATTCTTCTTTGAAT  150

seq1  CATCCCATTGTTTGTGTCTAGTTCTAGCCAAGTTAACGTGAACTCTTAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCATTGTTTGTGTCTAGTTCTAGCCAAGTTAACGTGAACTCTTAAC  200

seq1  CAGAGATGTTCTGAGTTTTGCCTGTAGTGAGGTGAATGACAGGGGCTGTG  250
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CAGAGATGTTCTGAGTTTTGCCTGTAGTGAGGTGGATGACAGGGGCTGTG  250

seq1  GCTACTTGGTCACTAGAGAATAAGAGAAAGATTGCTTTTAAGGAGCTTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACTTGGTCACTAGAGAATAAGAGAAAGATTGCTTTTAAGGAGCTTTT  300

seq1  GTAGCTTGACAGTTCTGCTGTGTGCATATAATTTCAGAAGCAGACCATAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTTGACAGTTCTGCTGTGTGCATATAATTTCAGAAGCAGACCATAG  350

seq1  CACGCAGTTGAGAATTTGGGACACTGTTTTGATTTAAGAAAAGTCCTAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGCAGTTGAGAATTTGGGACACTGTTTTGATTTAAGAAAAGTCCTAGA  400

seq1  GCAACATTAACAGATCATGCCTCCTATGTGGTAACATTTCAGATTCACTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACATTAACAGATCATGCCTCCTATGTGGTAACATTTCAGATTCACTT  450

seq1  CTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTAAATAGAGATGAGGTCTTGCTGTCTTG  500
      |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTC--TTTTTTTTTTTTTTAAATAGAGATGAGGTCTTGCTGTCTTG  498

seq1  GCCAGGTTAGTCTTGAACTCCTAGGTTTAAGTGATCCTCCTGTCTTGGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGGTTAGTCTTGAACTCCTAGGTTTAAGTGATCCTCCTGTCTTGGCC  548

seq1  TTCCAAAGTGCCGGGATTATAGACATGAGCCACTATACCTGGCCCAGACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAAAGTGCCGGGATTATAGACATGAGCCACTATACCTGGCCCAGACT  598

seq1  CACTTCTTATAGGAAAGATGCTGCCTTCATCATTTAATAAAGGCTTTCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTCTTATAGGAAAGATGCTGCCTTCATCATTTAATAAAGGCTTTCAG  648

seq1  AATGTTTTATGTAAAATAAATGCTTTCATATTAAAATTCTCATAGATGTT  700
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AATGTTTTATGTAAAATAAATGCTTTCATATT-AAATTCTCATAGATGTT  697

seq1  TGAACTGGATAAATAATATGTCAT  724
      ||||||||| ||| ||||||||||
seq2  TGAACTGGA-AAAAAATATGTCAT  720