Top
IDB6Ng01-227L05
Information of forward sequence (DDBJ: GA041303)
Chromosome 13 position(base) 12832751 - 12833904 strand -
Alignment
seq1: chr13_12832751_12833904
seq2: B6Ng01-227L05.b_46_1200 (reverse)

seq1  TATATACAACATGAACAAGAT-CTGACCCAATATTTTAAAGTTTACCTCT  49
      ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||
seq2  TATAT-CAACATGAAC-AGATCCTGACCC-ATATTTT-AAGTTTACTTCT  46

seq1  TATTATCATCTCAT-ATTTCAGTGTTATGTAAA-CTGATGCCAAAT-ATC  96
      || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||
seq2  TA-TATCATCTCATAATTTCAGTGTTATGTAAACCTGATGCCAAATAATC  95

seq1  TATTGTACCTAAAATTAATATATCTGAAACTATAATCTGAGCAAAAGAAT  146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGTACCTAAAATTAATATATCTGAAACTATAATCTGAGCAAAAGAAT  145

seq1  -ACACTGCAAAGAACAGCAAATGAAGTGAGTGCTA-TATCAAATAAAAAG  194
       |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AACACTGCAAAGAACAGCAAATGAAGTGAGTGCTATTATCAAATAAAAAG  195

seq1  TTTTCCTGTCACTTAACAAAACAACAGTCAACAATTTGCACCCTCTTACG  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCTGTCACTTAACAAAACAACAGTCAACAATTTGCACCCTCTTACG  245

seq1  ATGGGAACCAAGAGTATGAAAACCACACATGGACTGTAAGAGTTCACATG  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGAACCAAGAGTATGAAAACCACACATGGACTGTAAGAGTTCACATG  295

seq1  GGACTCTTCCACTCCTGAAACTGAGTAACTAGACTGCTTTGACAGCTATT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTCTTCCACTCCTGAAACTGAGTAACTAGACTGCTTTGACAGCTATT  345

seq1  AAAATGAACAGTTAAAGTAATCCTTTCCAACAAGAAACAGTATCTCAAAG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGAACAGTTAAAGTAATCCTTTCCAACAAGAAACAGTATCTCAAAG  395

seq1  ATGACTGATGGGGAAAAATTATCACAAGAGATTAGAATTACCATCATCTC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTGATGGGGAAAAATTATCACAAGAGATTAGAATTACCATCATCTC  445

seq1  AAACACTGAGAACAATGAATCAACATTGGTCTCTTACCTGCATTATTCCT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACTGAGAACAATGAATCAACATTGGTCTCTTACCTGCATTATTCCT  495

seq1  AAGAAAAGGAAATCCAGAATAAGGGAGACAATGAAATGTCATGGGAACAT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAAGGAAATCCAGAATAAGGGAGACAATGAAATGTCATGGGAACAT  545

seq1  CAGTCTTCTCACTTTGGTGATGCCAGTCACCAGGAGATGAAGGGGAAGTA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTTCTCACTTTGGTGATGCCAGTCACCAGGAGATGAAGGGGAAGTA  595

seq1  GTAAACAATGTGGGTATCAGTTGAAGTTGATGTGACCTGGAGAAGCATTA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAACAATGTGGGTATCAGTTGAAGTTGATGTGACCTGGAGAAGCATTA  645

seq1  GCAGCCCGACTGAAGAGAAGATATAAAAATTGTTAAGACGATGCTAACAA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCCCGACTGAAGAGAAGATATAAAAATTGTTAAGACGATGCTAACAA  695

seq1  GAACCTTCTGTTTCTAAGAAGCTTATTGATGTACTGAAGTGAAGCATCCT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTTCTGTTTCTAAGAAGCTTATTGATGTACTGAAGTGAAGCATCCT  745

seq1  TTAATATTTTCTCTTTGAAACAATTCTGGGTTCAATGAGACTGTTCTTTA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATATTTTCTCTTTGAAACAATTCTGGGTTCAATGAGACTGTTCTTTA  795

seq1  ATATTAGAAACCTATTGGGCAGTGGTGGTGAATGCCTTTAATCGCAGCAC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTAGAAACCTATTGGGCAGTGGTGGTGAATGCCTTTAATCGCAGCAC  845

seq1  TTCGGAGGCAGAGGCAGGTGGATTTCTGAGTTCGAGGGCAGCCTGGTCTA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGGAGGCAGAGGCAGGTGGATTTCTGAGTTCGAGGGCAGCCTGGTCTA  895

seq1  CAGAGTGAGTTCCAGGACAGTCCGGGCTACACAGAGAAACCGTGTTTTAG  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTGAGTTCCAGGACAGTCCGGGCTACACAGAGAAACCGTGTTTTAG  945

seq1  AAAACAAACAAACAAACAAACAATATTAGAAACCATTGTATAGCAACCAC  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAAACAAACAAACAAACAATATTAGAAACCATTGTATAGCAACCAC  995

seq1  CAGCCTTCTCATGATTTTATCATGGTATATTTCAGACTATTTAAAAATTA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCTTCTCATGATTTTATCATGGTATATTTCAGACTATTTAAAAATTA  1045

seq1  CAGTCTACTTAGGGATAGACTAGTTGCATAGTATTTGTAATGTTGTTAAC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTACTTAGGGATAGACTAGTTGCATAGTATTTGTAATGTTGTTAAC  1095

seq1  TTCAATGAAAATGTGGGCTGATTAAAAGTGGCTGGCTTTCATAATAGATA  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATGAAAATGTGGGCTGATTAAAAGTGGCTGGCTTTCATAATAGATA  1145

seq1  TAAAGAATTC  1154
      ||||||||||
seq2  TAAAGAATTC  1155

Information of reverse sequence (DDBJ: GA041304)
Chromosome 12 position(base) 10330895 - 10331183 strand -
Alignment
seq1: chr12_10330895_10331183
seq2: B6Ng01-227L05.g_417_710 (reverse)

seq1  CTACAAAAGGCTATACTCAACAAAACTGGAAAACCTGGATGAAATGGACA  50
      ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
seq2  CTACAAAAGCCCATACTCAACAAAACTGGAAAATCTGGATGAAATAGACA  50

seq1  AATTCCTAGACAGATACCAGGTACCAAAGTTAAATCAGGATCAGGTTAAT  100
      | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || 
seq2  ATTTACTAGACAGATACCAGGTACCAAAGTTAAATCAAGATCAGATAAAC  100

seq1  GATCT-AAACAGTCCTATAACCCCTAAAGAAATAGAAGCAGTCATTAATT  149
       || | ||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||  
seq2  CATATAAAACATTCC-ACAACCCGTAAAG-AATAGAAGCAGACATTAAGA  148

seq1  GTCTCCCAACCA-------AAAAAAGCCCAGGACCAGATGGATTTAGTGC  192
      | |||||| | |       ||||||| ||| ||| |||||| | ||||||
seq2  GACTCCCAGCAACGACAACAAAAAAGTCCAAGACAAGATGGTTGTAGTGC  198

seq1  AGAGTTCTATCAGACCTTCAAATAAGATCTAATTCCAGTACTTCACAAAC  242
      ||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| | | ||||     || 
seq2  AGAATTCTACCAGACCTTTAAAGAAGACCTAATACAAATACT--CTTAAT  246

seq1  TATTCCCCAAAATAGAAGCAGAAGG-ACTCTATCCAATTCATTCTATG  289
      | |||| |||||||||| | ||||| |  ||| |||||||||||||||
seq2  TGTTCCACAAAATAGAAACTGAAGGAAAACTACCCAATTCATTCTATG  294