Top
IDMSMg01-130L13
Information of forward sequence (DDBJ: AG338402)
Chromosome 10 position(base) 70502740 - 70503047 strand -
Alignment
seq1: chr10_70502740_70503047
seq2: MSMg01-130L13.T7_506_711 (reverse)

seq1  TACATATATATATATATATATATATATATATATACACAAACACACACACA  50
                            || ||||||||| | |||   |||||| 
seq2  ----------------------TACATATATATAGAGAAA---ACACACC  25

seq1  TATATATATATATTCCAGTAAGTGTTGATATATATGTCTGATTTTCTAGG  100
      | | |             || | | ||| | | |||   || | |||   
seq2  TCTTT-------------TACGCG-TGA-AAAAATGAAAGACTCTCT---  57

seq1  CATGTTAATATTTTCATACATACTATACACATATATAATATACATATATA  150
              ||| |  |||||  | | |||||||||| |||  | ||||||
seq2  -------CTATAT--ATACACGC-ACACACATATAT-ATACCCCTATATA  96

seq1  TAACATGTATATAATATACATGTATGTTATACATGTTTATATGTATATGT  200
      |    | | |||          ||| || ||    || |||| ||||   
seq2  T----TTTTTAT----------TATTTTTTA----TTGATATATATA---  125

seq1  GTATATCATGTATGTGTATACATGTATATACATACATCATATATATGTGT  250
                              ||||||   | |  |||| | ||  |
seq2  ------------------------TATATA---AAAAGATATTTGTGATT  148

seq1  GTATGTGTGTGTGTATATATATATATGTATATATATATATATATATACAT  300
       | | | ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATATGTATATATATATATATATGTGTATATATATATATATATACAT  198

seq1  ATATATAT  308
      ||||||||
seq2  ATATATAT  206

Information of reverse sequence (DDBJ: AG338403)
Chromosome 13 position(base) 14522836 - 14523351 strand -
Alignment
seq1: chr13_14522836_14523351
seq2: MSMg01-130L13.TJ_143_633 (reverse)

seq1  AAAATCCACTTATCAGTGAGTACATATCATGTGAGCTCTTTTGTGATTGG  50
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||
seq2  AAAATCCACTTATCAGTGAGTACATATCATTTGAGTTCTTTTGTGATTGG  50

seq1  GTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTGCAGGTCCATCCATTTGCCTAGGAA  100
      ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||
seq2  GTTACCTCACTCAGGATGATGACTTCCAGGTCCATCCATTTCCCTAGGAA  100

seq1  TTTCATAAATTCATTATTTTTAATAGCTGAGTAGTACTCCATTGTGTAAA  150
      ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||
seq2  TTTCATAAATTCATTCTATTTAATAGCTGAGTAGTACTCCATTTTGCAAA  150

seq1  TGTACCACATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTTGAGGGGCATGTGGGTTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TGTACCACATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTTGAGGGGCATCTGGGTTCT  200

seq1  TGCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAAAACTGCTATGAACATAGTGGAGGA  250
      | |||||||||||||||||||                       |||| |
seq2  TTCCAGCTTCTGGCTATTATA-----------------------GGAGCA  227

seq1  TATGTCCTTCTTACCGGTTGGAACATCTTCTGGATATATGCCCAGGAGAG  300
      | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCCTTCTTACCGGTCGGAACATCTTCTGGATATATGCCCAGGAGAG  277

seq1  GTATTGCAGGACCCTCTGGTAGTACTATGTCCAAGTTTTTGAGGAACCGC  350
      ||||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||
seq2  GTATTGCGGGATCCTCCGGTAGTACTATGTCTAATTTTATGAGGAACCGC  327

seq1  CAGACTGCTTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCTCACAATCCCACCAACAATG  400
      ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
seq2  CAGACTGATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCTTGTAATCCCACCAACAATG  377

seq1  GAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCCTCGCCAGCATCTGCTGTCACCTG  450
      |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||
seq2  GAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCCTCATGAGCATCTTCTGTCACCTG  427

seq1  AATTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGGTGTGAGGTGGAATCTCAGGGTT  500
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AATTTTTGATCTTAG-CATTCTGACTGGTGTGAGATGGAATCTCAGGGTT  476

seq1  GTTTTGATTTGCATTT  516
      | |||||||| |||||
seq2  G-TTTGATTTCCATTT  491